Косяк ( дверной ) и косить - однокоренные слова?

Нет, у них общий корень, но значение у них разное.
Однокоренные слова - это те слова, у которых имеется одинаковый корень и у которых одинаковое значение. В данном случае значения разные.

нет они не однокоренные