Кол-во грамматический основ :
И всем стало сразу ясно,что она пришла к ним затем,чтобы сделать то ,что хочет.

кажется, 3 основы здесь 

2. А именно:
1)И всем сразу стало ясно (односоставное, т.к. есть только сказуемое "стало")
2)Что она пришла к ним затем,чтобы сделать то, что хочет (двусоставное, т.к. есть и подлежащее "она" и три однородных сказуемых "пришла, чтобы сделать" и "что хочет".