Казалось, весь мир поглотила уже эта бесформенная тьма, охватившая одинаково
и тучи, и воздух, и море.
Объясните знаки препинания

Потому что тучи воздух и море являются однородными членами

перед казалось запятая стоит потому, что это сложное предложение с подчинительной связью, охватившая одинаково-это деепричастный оборот, и море,и воздух,и море-однородные слова.
Вроде бы так:)