Также в древности не вывозили навоз на поля , и тот оставался лежать рядом с хлевом.
Зачем нужна запятая?

Я напишу правило к союзу и.
Правило:
Перед союзом "и" не пишется запятых. НО! Если это сложное предложение или союз "и" повторяется несколько раз, то он пишется.
Примеры:
Я хочу есть и пить.
Я люблю хлеб, и моя мама тоже. (сложное предложение.)
Я люблю и чернику, и малину, и клубнику! (союз "и" повторяется)
--
В твоем случае сложное предложение. Союз "и" пишется.