почему слова он и пенал это разные части речи

Он- это местоимение
Пенал- это существительное

Он - это местоимение. Мы не понимаем о ком или очём именно идёт речь, потому что местоимение не называет предмет. Пенал - существительное, тут сразу ясно о каком предмете идёт речь, потому что существительное называет предмет.