2) Считалось, что среди губок есть только фильтраторы, но позже были найдены сверлящие губки, которые наносят существенный вред судоходству, разрушают горные породы и оставляют причудливые отверстия в скалах. С чем связан такой образ жизни? Какие преимущества он дает?

Сверлящие губки точнее Клионы, еще в форме личинки отваливаясь от материнского организма прилипает к определенной поверхности и начинает превращение в губку, после метаморфоза он начинает "просверливать" себе так называемое "убежище".
Так же клионы являются паразитами и очень часто наносят вред устричным плантациям, просверливая себе дом внутри устрицы которая позже умирает из-за пряничной болезни.