Какие измерения и сравнения надо проводить, чтобы сравнить скорости
прохождения горячей и холодной воды через слой почвы?

Чтобы сравнить скорости прохождения горячей и холодной воды через слой почвы, необходимо засечь время, а затем сравнить количество воды в каждом стакане, которое прошло через почву за данный промежуток времени.